Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Eftud2O08810 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Eftud2O08810 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms