Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PrkcshO08795 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrkcshO08795 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrkcshO08795 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrkcshO08795 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrkcshO08795 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrkcshO08795 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrkcshO08795 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrkcshO08795 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrkcshO08795 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrkcshO08795 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrkcshO08795 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrkcshO08795 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrkcshO08795 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrkcshO08795 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrkcshO08795 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrkcshO08795 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrkcshO08795 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrkcshO08795 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrkcshO08795 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrkcshO08795 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrkcshO08795 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrkcshO08795 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrkcshO08795 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrkcshO08795 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrkcshO08795 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PrkcshO08795 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PrkcshO08795 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PrkcshO08795 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PrkcshO08795 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PrkcshO08795 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrkcshO08795 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrkcshO08795 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrkcshO08795 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrkcshO08795 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrkcshO08795 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrkcshO08795 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrkcshO08795 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrkcshO08795 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrkcshO08795 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrkcshO08795 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrkcshO08795 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PrkcshO08795 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrkcshO08795 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrkcshO08795 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PrkcshO08795 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrkcshO08795 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrkcshO08795 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrkcshO08795 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrkcshO08795 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PrkcshO08795 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PrkcshO08795 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PrkcshO08795 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PrkcshO08795 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PrkcshO08795 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PrkcshO08795 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrkcshO08795 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrkcshO08795 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrkcshO08795 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrkcshO08795 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrkcshO08795 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrkcshO08795 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrkcshO08795 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrkcshO08795 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrkcshO08795 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrkcshO08795 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrkcshO08795 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrkcshO08795 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrkcshO08795 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrkcshO08795 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrkcshO08795 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrkcshO08795 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrkcshO08795 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrkcshO08795 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PrkcshO08795 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrkcshO08795 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrkcshO08795 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrkcshO08795 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms