Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CltaO08585 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CltaO08585 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CltaO08585 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CltaO08585 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CltaO08585 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CltaO08585 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CltaO08585 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CltaO08585 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CltaO08585 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CltaO08585 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CltaO08585 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CltaO08585 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CltaO08585 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CltaO08585 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CltaO08585 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CltaO08585 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CltaO08585 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CltaO08585 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CltaO08585 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CltaO08585 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CltaO08585 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CltaO08585 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CltaO08585 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CltaO08585 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CltaO08585 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CltaO08585 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CltaO08585 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CltaO08585 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CltaO08585 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CltaO08585 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CltaO08585 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CltaO08585 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CltaO08585 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CltaO08585 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CltaO08585 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CltaO08585 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CltaO08585 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CltaO08585 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CltaO08585 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CltaO08585 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CltaO08585 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CltaO08585 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CltaO08585 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CltaO08585 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CltaO08585 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CltaO08585 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CltaO08585 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CltaO08585 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CltaO08585 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CltaO08585 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CltaO08585 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CltaO08585 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CltaO08585 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CltaO08585 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CltaO08585 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CltaO08585 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CltaO08585 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CltaO08585 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CltaO08585 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CltaO08585 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CltaO08585 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CltaO08585 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CltaO08585 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CltaO08585 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CltaO08585 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CltaO08585 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CltaO08585 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CltaO08585 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CltaO08585 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CltaO08585 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CltaO08585 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CltaO08585 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CltaO08585 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CltaO08585 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CltaO08585 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CltaO08585 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CltaO08585 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CltaO08585 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CltaO08585 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CltaO08585 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CltaO08585 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CltaO08585 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CltaO08585 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CltaO08585 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CltaO08585 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CltaO08585 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CltaO08585 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CltaO08585 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CltaO08585 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CltaO08585 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CltaO08585 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CltaO08585 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CltaO08585 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CltaO08585 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CltaO08585 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CltaO08585 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CltaO08585 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CltaO08585 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CltaO08585 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms