Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MsmbO08540 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MsmbO08540 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MsmbO08540 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MsmbO08540 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MsmbO08540 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MsmbO08540 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MsmbO08540 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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