Protein–RNA interactions for Protein: K9J7E2

Gm4312, Predicted gene 4301, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4312K9J7E2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm4312K9J7E2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm4312K9J7E2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm4312K9J7E2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm4312K9J7E2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm4312K9J7E2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm4312K9J7E2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm4312K9J7E2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm4312K9J7E2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm4312K9J7E2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm4312K9J7E2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm4312K9J7E2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm4312K9J7E2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm4312K9J7E2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm4312K9J7E2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm4312K9J7E2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm4312K9J7E2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm4312K9J7E2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm4312K9J7E2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm4312K9J7E2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm4312K9J7E2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm4312K9J7E2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm4312K9J7E2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm4312K9J7E2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm4312K9J7E2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm4312K9J7E2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm4312K9J7E2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm4312K9J7E2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm4312K9J7E2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm4312K9J7E2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm4312K9J7E2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm4312K9J7E2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm4312K9J7E2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm4312K9J7E2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm4312K9J7E2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm4312K9J7E2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm4312K9J7E2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm4312K9J7E2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm4312K9J7E2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm4312K9J7E2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm4312K9J7E2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm4312K9J7E2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm4312K9J7E2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm4312K9J7E2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 231.6 ms