Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm379J3QQ19 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm379J3QQ19 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm379J3QQ19 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm379J3QQ19 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm379J3QQ19 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm379J3QQ19 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm379J3QQ19 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm379J3QQ19 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm379J3QQ19 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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Gm379J3QQ19 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm379J3QQ19 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
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Gm379J3QQ19 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
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Gm379J3QQ19 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm379J3QQ19 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm379J3QQ19 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm379J3QQ19 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm379J3QQ19 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm379J3QQ19 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm379J3QQ19 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm379J3QQ19 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm379J3QQ19 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm379J3QQ19 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm379J3QQ19 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm379J3QQ19 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm379J3QQ19 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm379J3QQ19 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm379J3QQ19 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm379J3QQ19 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm379J3QQ19 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm379J3QQ19 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm379J3QQ19 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm379J3QQ19 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm379J3QQ19 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm379J3QQ19 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm379J3QQ19 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm379J3QQ19 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm379J3QQ19 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm379J3QQ19 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm379J3QQ19 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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