Protein–RNA interactions for Protein: J3QPR6

Rfpl4b, MCG1377, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfpl4bJ3QPR6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rfpl4bJ3QPR6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfpl4bJ3QPR6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfpl4bJ3QPR6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfpl4bJ3QPR6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfpl4bJ3QPR6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfpl4bJ3QPR6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfpl4bJ3QPR6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfpl4bJ3QPR6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfpl4bJ3QPR6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfpl4bJ3QPR6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfpl4bJ3QPR6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfpl4bJ3QPR6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfpl4bJ3QPR6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfpl4bJ3QPR6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfpl4bJ3QPR6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rfpl4bJ3QPR6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rfpl4bJ3QPR6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rfpl4bJ3QPR6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rfpl4bJ3QPR6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rfpl4bJ3QPR6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rfpl4bJ3QPR6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rfpl4bJ3QPR6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rfpl4bJ3QPR6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rfpl4bJ3QPR6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rfpl4bJ3QPR6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rfpl4bJ3QPR6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rfpl4bJ3QPR6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rfpl4bJ3QPR6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rfpl4bJ3QPR6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rfpl4bJ3QPR6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rfpl4bJ3QPR6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rfpl4bJ3QPR6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rfpl4bJ3QPR6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rfpl4bJ3QPR6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rfpl4bJ3QPR6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rfpl4bJ3QPR6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rfpl4bJ3QPR6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rfpl4bJ3QPR6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rfpl4bJ3QPR6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rfpl4bJ3QPR6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rfpl4bJ3QPR6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rfpl4bJ3QPR6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rfpl4bJ3QPR6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rfpl4bJ3QPR6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rfpl4bJ3QPR6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rfpl4bJ3QPR6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rfpl4bJ3QPR6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rfpl4bJ3QPR6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rfpl4bJ3QPR6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rfpl4bJ3QPR6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rfpl4bJ3QPR6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rfpl4bJ3QPR6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rfpl4bJ3QPR6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rfpl4bJ3QPR6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rfpl4bJ3QPR6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rfpl4bJ3QPR6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rfpl4bJ3QPR6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rfpl4bJ3QPR6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rfpl4bJ3QPR6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rfpl4bJ3QPR6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rfpl4bJ3QPR6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rfpl4bJ3QPR6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rfpl4bJ3QPR6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rfpl4bJ3QPR6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rfpl4bJ3QPR6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rfpl4bJ3QPR6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rfpl4bJ3QPR6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rfpl4bJ3QPR6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rfpl4bJ3QPR6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rfpl4bJ3QPR6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rfpl4bJ3QPR6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rfpl4bJ3QPR6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rfpl4bJ3QPR6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rfpl4bJ3QPR6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rfpl4bJ3QPR6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rfpl4bJ3QPR6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rfpl4bJ3QPR6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rfpl4bJ3QPR6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rfpl4bJ3QPR6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rfpl4bJ3QPR6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rfpl4bJ3QPR6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rfpl4bJ3QPR6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rfpl4bJ3QPR6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rfpl4bJ3QPR6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rfpl4bJ3QPR6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rfpl4bJ3QPR6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rfpl4bJ3QPR6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rfpl4bJ3QPR6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rfpl4bJ3QPR6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rfpl4bJ3QPR6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rfpl4bJ3QPR6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rfpl4bJ3QPR6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rfpl4bJ3QPR6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rfpl4bJ3QPR6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rfpl4bJ3QPR6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rfpl4bJ3QPR6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rfpl4bJ3QPR6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rfpl4bJ3QPR6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rfpl4bJ3QPR6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms