Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34c2J3QNM1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34c2J3QNM1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34c2J3QNM1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34c2J3QNM1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34c2J3QNM1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34c2J3QNM1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34c2J3QNM1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34c2J3QNM1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34c2J3QNM1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34c2J3QNM1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34c2J3QNM1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34c2J3QNM1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34c2J3QNM1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34c2J3QNM1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34c2J3QNM1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34c2J3QNM1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34c2J3QNM1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34c2J3QNM1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34c2J3QNM1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34c2J3QNM1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34c2J3QNM1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn34c2J3QNM1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn34c2J3QNM1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn34c2J3QNM1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn34c2J3QNM1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34c2J3QNM1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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