Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm21972J3QN38 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms