Protein–RNA interactions for Protein: J3QMM6

Gm21746, Predicted gene, 21746, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21746J3QMM6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms