Protein–RNA interactions for Protein: J3QK27

Gm21693, Predicted gene, 21693, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21693J3QK27 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21693J3QK27 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21693J3QK27 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21693J3QK27 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21693J3QK27 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21693J3QK27 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21693J3QK27 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21693J3QK27 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21693J3QK27 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21693J3QK27 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21693J3QK27 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21693J3QK27 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21693J3QK27 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21693J3QK27 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21693J3QK27 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Gm21693J3QK27 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Gm21693J3QK27 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Gm21693J3QK27 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Gm21693J3QK27 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Gm21693J3QK27 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gm21693J3QK27 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gm21693J3QK27 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gm21693J3QK27 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm21693J3QK27 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm21693J3QK27 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21693J3QK27 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gm21693J3QK27 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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