Protein–RNA interactions for Protein: J3QJZ1

Gm21969, Predicted gene 21969, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21969J3QJZ1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm21969J3QJZ1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm21969J3QJZ1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm21969J3QJZ1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm21969J3QJZ1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm21969J3QJZ1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm21969J3QJZ1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm21969J3QJZ1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm21969J3QJZ1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm21969J3QJZ1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm21969J3QJZ1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm21969J3QJZ1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm21969J3QJZ1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm21969J3QJZ1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm21969J3QJZ1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm21969J3QJZ1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm21969J3QJZ1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm21969J3QJZ1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm21969J3QJZ1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm21969J3QJZ1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm21969J3QJZ1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm21969J3QJZ1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm21969J3QJZ1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm21969J3QJZ1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm21969J3QJZ1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm21969J3QJZ1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm21969J3QJZ1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm21969J3QJZ1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm21969J3QJZ1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm21969J3QJZ1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm21969J3QJZ1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm21969J3QJZ1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm21969J3QJZ1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm21969J3QJZ1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm21969J3QJZ1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm21969J3QJZ1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm21969J3QJZ1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm21969J3QJZ1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm21969J3QJZ1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm21969J3QJZ1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm21969J3QJZ1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm21969J3QJZ1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm21969J3QJZ1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm21969J3QJZ1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm21969J3QJZ1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm21969J3QJZ1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm21969J3QJZ1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm21969J3QJZ1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms