Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AK157302I3ITR1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
AK157302I3ITR1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AK157302I3ITR1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AK157302I3ITR1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AK157302I3ITR1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AK157302I3ITR1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AK157302I3ITR1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AK157302I3ITR1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AK157302I3ITR1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
AK157302I3ITR1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AK157302I3ITR1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AK157302I3ITR1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AK157302I3ITR1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AK157302I3ITR1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AK157302I3ITR1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AK157302I3ITR1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AK157302I3ITR1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
AK157302I3ITR1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AK157302I3ITR1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AK157302I3ITR1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AK157302I3ITR1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AK157302I3ITR1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AK157302I3ITR1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AK157302I3ITR1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AK157302I3ITR1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AK157302I3ITR1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AK157302I3ITR1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AK157302I3ITR1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AK157302I3ITR1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AK157302I3ITR1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AK157302I3ITR1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AK157302I3ITR1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
AK157302I3ITR1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AK157302I3ITR1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AK157302I3ITR1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AK157302I3ITR1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AK157302I3ITR1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
AK157302I3ITR1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AK157302I3ITR1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AK157302I3ITR1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
AK157302I3ITR1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AK157302I3ITR1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
AK157302I3ITR1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
AK157302I3ITR1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AK157302I3ITR1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AK157302I3ITR1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AK157302I3ITR1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AK157302I3ITR1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AK157302I3ITR1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AK157302I3ITR1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms