Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hmgxb3G3X9M3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hmgxb3G3X9M3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hmgxb3G3X9M3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hmgxb3G3X9M3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hmgxb3G3X9M3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hmgxb3G3X9M3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hmgxb3G3X9M3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hmgxb3G3X9M3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hmgxb3G3X9M3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hmgxb3G3X9M3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hmgxb3G3X9M3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hmgxb3G3X9M3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmgxb3G3X9M3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmgxb3G3X9M3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmgxb3G3X9M3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmgxb3G3X9M3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmgxb3G3X9M3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmgxb3G3X9M3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmgxb3G3X9M3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmgxb3G3X9M3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmgxb3G3X9M3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmgxb3G3X9M3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmgxb3G3X9M3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmgxb3G3X9M3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmgxb3G3X9M3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmgxb3G3X9M3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmgxb3G3X9M3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmgxb3G3X9M3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmgxb3G3X9M3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmgxb3G3X9M3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmgxb3G3X9M3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hmgxb3G3X9M3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hmgxb3G3X9M3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hmgxb3G3X9M3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hmgxb3G3X9M3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hmgxb3G3X9M3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hmgxb3G3X9M3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hmgxb3G3X9M3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hmgxb3G3X9M3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hmgxb3G3X9M3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hmgxb3G3X9M3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hmgxb3G3X9M3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hmgxb3G3X9M3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms