Protein–RNA interactions for Protein: G3UXD1

Speer4c, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4cG3UXD1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Speer4cG3UXD1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Speer4cG3UXD1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Speer4cG3UXD1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Speer4cG3UXD1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Speer4cG3UXD1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Speer4cG3UXD1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Speer4cG3UXD1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Speer4cG3UXD1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Speer4cG3UXD1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Speer4cG3UXD1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Speer4cG3UXD1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Speer4cG3UXD1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Speer4cG3UXD1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Speer4cG3UXD1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Speer4cG3UXD1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Speer4cG3UXD1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Speer4cG3UXD1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Speer4cG3UXD1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Speer4cG3UXD1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Speer4cG3UXD1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Speer4cG3UXD1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Speer4cG3UXD1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Speer4cG3UXD1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms