Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Srp72F8VQC1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Srp72F8VQC1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Srp72F8VQC1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms