Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Usp9yF8VPU6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp9yF8VPU6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms