Protein–RNA interactions for Protein: F6WIE4

Gm10563, Predicted gene 10563, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10563F6WIE4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Gm10563F6WIE4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gm10563F6WIE4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gm10563F6WIE4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gm10563F6WIE4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gm10563F6WIE4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gm10563F6WIE4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gm10563F6WIE4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Gm10563F6WIE4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gm10563F6WIE4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Gm10563F6WIE4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gm10563F6WIE4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gm10563F6WIE4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gm10563F6WIE4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gm10563F6WIE4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gm10563F6WIE4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gm10563F6WIE4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gm10563F6WIE4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gm10563F6WIE4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Gm10563F6WIE4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gm10563F6WIE4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gm10563F6WIE4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gm10563F6WIE4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gm10563F6WIE4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gm10563F6WIE4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gm10563F6WIE4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gm10563F6WIE4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gm10563F6WIE4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gm10563F6WIE4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Gm10563F6WIE4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gm10563F6WIE4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gm10563F6WIE4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gm10563F6WIE4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gm10563F6WIE4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gm10563F6WIE4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gm10563F6WIE4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gm10563F6WIE4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gm10563F6WIE4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gm10563F6WIE4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gm10563F6WIE4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gm10563F6WIE4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gm10563F6WIE4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gm10563F6WIE4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gm10563F6WIE4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gm10563F6WIE4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gm10563F6WIE4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gm10563F6WIE4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gm10563F6WIE4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gm10563F6WIE4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gm10563F6WIE4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gm10563F6WIE4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gm10563F6WIE4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gm10563F6WIE4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gm10563F6WIE4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gm10563F6WIE4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gm10563F6WIE4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gm10563F6WIE4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gm10563F6WIE4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gm10563F6WIE4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gm10563F6WIE4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gm10563F6WIE4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gm10563F6WIE4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gm10563F6WIE4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gm10563F6WIE4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gm10563F6WIE4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gm10563F6WIE4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gm10563F6WIE4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gm10563F6WIE4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gm10563F6WIE4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gm10563F6WIE4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gm10563F6WIE4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gm10563F6WIE4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gm10563F6WIE4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gm10563F6WIE4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Gm10563F6WIE4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gm10563F6WIE4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gm10563F6WIE4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gm10563F6WIE4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gm10563F6WIE4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gm10563F6WIE4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gm10563F6WIE4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Gm10563F6WIE4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gm10563F6WIE4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gm10563F6WIE4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gm10563F6WIE4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gm10563F6WIE4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gm10563F6WIE4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gm10563F6WIE4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gm10563F6WIE4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gm10563F6WIE4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gm10563F6WIE4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gm10563F6WIE4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gm10563F6WIE4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gm10563F6WIE4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gm10563F6WIE4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gm10563F6WIE4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gm10563F6WIE4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gm10563F6WIE4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gm10563F6WIE4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gm10563F6WIE4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms