Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Gm28305F6U473 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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