Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm29094F6Q785 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm29094F6Q785 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm29094F6Q785 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm29094F6Q785 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm29094F6Q785 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm29094F6Q785 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm29094F6Q785 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm29094F6Q785 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm29094F6Q785 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm29094F6Q785 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm29094F6Q785 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm29094F6Q785 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm29094F6Q785 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm29094F6Q785 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm29094F6Q785 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm29094F6Q785 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm29094F6Q785 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm29094F6Q785 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm29094F6Q785 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm29094F6Q785 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm29094F6Q785 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm29094F6Q785 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm29094F6Q785 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm29094F6Q785 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm29094F6Q785 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm29094F6Q785 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm29094F6Q785 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm29094F6Q785 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm29094F6Q785 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms