Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Raph1F2Z3U3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Raph1F2Z3U3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Raph1F2Z3U3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Raph1F2Z3U3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Raph1F2Z3U3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Raph1F2Z3U3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Raph1F2Z3U3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Raph1F2Z3U3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Raph1F2Z3U3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Raph1F2Z3U3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Raph1F2Z3U3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Raph1F2Z3U3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Raph1F2Z3U3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Raph1F2Z3U3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Raph1F2Z3U3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Raph1F2Z3U3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Raph1F2Z3U3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Raph1F2Z3U3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Raph1F2Z3U3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Raph1F2Z3U3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Raph1F2Z3U3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Raph1F2Z3U3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms