Protein–RNA interactions for Protein: E9QAF4

Phldb3, Pleckstrin homology-like domain, family B, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phldb3E9QAF4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Phldb3E9QAF4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Phldb3E9QAF4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Phldb3E9QAF4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Phldb3E9QAF4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Phldb3E9QAF4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Phldb3E9QAF4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Phldb3E9QAF4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Phldb3E9QAF4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Phldb3E9QAF4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Phldb3E9QAF4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Phldb3E9QAF4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Phldb3E9QAF4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Phldb3E9QAF4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Phldb3E9QAF4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Phldb3E9QAF4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Phldb3E9QAF4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Phldb3E9QAF4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Phldb3E9QAF4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Phldb3E9QAF4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Phldb3E9QAF4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Phldb3E9QAF4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Phldb3E9QAF4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Phldb3E9QAF4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Phldb3E9QAF4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Phldb3E9QAF4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Phldb3E9QAF4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Phldb3E9QAF4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Phldb3E9QAF4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Phldb3E9QAF4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Phldb3E9QAF4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Phldb3E9QAF4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Phldb3E9QAF4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Phldb3E9QAF4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Phldb3E9QAF4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Phldb3E9QAF4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Phldb3E9QAF4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Phldb3E9QAF4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Phldb3E9QAF4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Phldb3E9QAF4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Phldb3E9QAF4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Phldb3E9QAF4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Phldb3E9QAF4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Phldb3E9QAF4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Phldb3E9QAF4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Phldb3E9QAF4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Phldb3E9QAF4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Phldb3E9QAF4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Phldb3E9QAF4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Phldb3E9QAF4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Phldb3E9QAF4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Phldb3E9QAF4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Phldb3E9QAF4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Phldb3E9QAF4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Phldb3E9QAF4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Phldb3E9QAF4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Phldb3E9QAF4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Phldb3E9QAF4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Phldb3E9QAF4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Phldb3E9QAF4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Phldb3E9QAF4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Phldb3E9QAF4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Phldb3E9QAF4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Phldb3E9QAF4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Phldb3E9QAF4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Phldb3E9QAF4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Phldb3E9QAF4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Phldb3E9QAF4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Phldb3E9QAF4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Phldb3E9QAF4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Phldb3E9QAF4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Phldb3E9QAF4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Phldb3E9QAF4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Phldb3E9QAF4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Phldb3E9QAF4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Phldb3E9QAF4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Phldb3E9QAF4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Phldb3E9QAF4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Phldb3E9QAF4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Phldb3E9QAF4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Phldb3E9QAF4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Phldb3E9QAF4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Phldb3E9QAF4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Phldb3E9QAF4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Phldb3E9QAF4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Phldb3E9QAF4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Phldb3E9QAF4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Phldb3E9QAF4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms