Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc74aE9Q9U8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc74aE9Q9U8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms