Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
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Rdh16f1E9Q9P8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh16f1E9Q9P8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rdh16f1E9Q9P8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rdh16f1E9Q9P8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rdh16f1E9Q9P8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rdh16f1E9Q9P8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rdh16f1E9Q9P8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rdh16f1E9Q9P8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdh16f1E9Q9P8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdh16f1E9Q9P8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdh16f1E9Q9P8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdh16f1E9Q9P8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdh16f1E9Q9P8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdh16f1E9Q9P8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdh16f1E9Q9P8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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Rdh16f1E9Q9P8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdh16f1E9Q9P8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdh16f1E9Q9P8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Rdh16f1E9Q9P8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh16f1E9Q9P8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh16f1E9Q9P8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Rdh16f1E9Q9P8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Rdh16f1E9Q9P8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh16f1E9Q9P8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh16f1E9Q9P8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh16f1E9Q9P8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh16f1E9Q9P8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh16f1E9Q9P8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh16f1E9Q9P8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh16f1E9Q9P8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh16f1E9Q9P8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh16f1E9Q9P8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh16f1E9Q9P8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh16f1E9Q9P8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh16f1E9Q9P8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh16f1E9Q9P8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh16f1E9Q9P8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh16f1E9Q9P8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh16f1E9Q9P8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh16f1E9Q9P8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh16f1E9Q9P8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh16f1E9Q9P8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Rdh16f1E9Q9P8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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