Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TrdnE9Q9K5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TrdnE9Q9K5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TrdnE9Q9K5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TrdnE9Q9K5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TrdnE9Q9K5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TrdnE9Q9K5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TrdnE9Q9K5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TrdnE9Q9K5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TrdnE9Q9K5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TrdnE9Q9K5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TrdnE9Q9K5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TrdnE9Q9K5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TrdnE9Q9K5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TrdnE9Q9K5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TrdnE9Q9K5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TrdnE9Q9K5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TrdnE9Q9K5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TrdnE9Q9K5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TrdnE9Q9K5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TrdnE9Q9K5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TrdnE9Q9K5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TrdnE9Q9K5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TrdnE9Q9K5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TrdnE9Q9K5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TrdnE9Q9K5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TrdnE9Q9K5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TrdnE9Q9K5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TrdnE9Q9K5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TrdnE9Q9K5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TrdnE9Q9K5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TrdnE9Q9K5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TrdnE9Q9K5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TrdnE9Q9K5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TrdnE9Q9K5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TrdnE9Q9K5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TrdnE9Q9K5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TrdnE9Q9K5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TrdnE9Q9K5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TrdnE9Q9K5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TrdnE9Q9K5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TrdnE9Q9K5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TrdnE9Q9K5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TrdnE9Q9K5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TrdnE9Q9K5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TrdnE9Q9K5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TrdnE9Q9K5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TrdnE9Q9K5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TrdnE9Q9K5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TrdnE9Q9K5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TrdnE9Q9K5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TrdnE9Q9K5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TrdnE9Q9K5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TrdnE9Q9K5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TrdnE9Q9K5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TrdnE9Q9K5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TrdnE9Q9K5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TrdnE9Q9K5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TrdnE9Q9K5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TrdnE9Q9K5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TrdnE9Q9K5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TrdnE9Q9K5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TrdnE9Q9K5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TrdnE9Q9K5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TrdnE9Q9K5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TrdnE9Q9K5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TrdnE9Q9K5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TrdnE9Q9K5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TrdnE9Q9K5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TrdnE9Q9K5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TrdnE9Q9K5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TrdnE9Q9K5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TrdnE9Q9K5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TrdnE9Q9K5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TrdnE9Q9K5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TrdnE9Q9K5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TrdnE9Q9K5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TrdnE9Q9K5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms