Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc146E9Q9F7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc146E9Q9F7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc146E9Q9F7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc146E9Q9F7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc146E9Q9F7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc146E9Q9F7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc146E9Q9F7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc146E9Q9F7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc146E9Q9F7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc146E9Q9F7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc146E9Q9F7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc146E9Q9F7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc146E9Q9F7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc146E9Q9F7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc146E9Q9F7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc146E9Q9F7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc146E9Q9F7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc146E9Q9F7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc146E9Q9F7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc146E9Q9F7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc146E9Q9F7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc146E9Q9F7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc146E9Q9F7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc146E9Q9F7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc146E9Q9F7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc146E9Q9F7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc146E9Q9F7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc146E9Q9F7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc146E9Q9F7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc146E9Q9F7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc146E9Q9F7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc146E9Q9F7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc146E9Q9F7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc146E9Q9F7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc146E9Q9F7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc146E9Q9F7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc146E9Q9F7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc146E9Q9F7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc146E9Q9F7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc146E9Q9F7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc146E9Q9F7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc146E9Q9F7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc146E9Q9F7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc146E9Q9F7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc146E9Q9F7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc146E9Q9F7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc146E9Q9F7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc146E9Q9F7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc146E9Q9F7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc146E9Q9F7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc146E9Q9F7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc146E9Q9F7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc146E9Q9F7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc146E9Q9F7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc146E9Q9F7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc146E9Q9F7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc146E9Q9F7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc146E9Q9F7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc146E9Q9F7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc146E9Q9F7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc146E9Q9F7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc146E9Q9F7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc146E9Q9F7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc146E9Q9F7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc146E9Q9F7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc146E9Q9F7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc146E9Q9F7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc146E9Q9F7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc146E9Q9F7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc146E9Q9F7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc146E9Q9F7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc146E9Q9F7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc146E9Q9F7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc146E9Q9F7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc146E9Q9F7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc146E9Q9F7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc146E9Q9F7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc146E9Q9F7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc146E9Q9F7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc146E9Q9F7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc146E9Q9F7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc146E9Q9F7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc146E9Q9F7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc146E9Q9F7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc146E9Q9F7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc146E9Q9F7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc146E9Q9F7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc146E9Q9F7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc146E9Q9F7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc146E9Q9F7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc146E9Q9F7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc146E9Q9F7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms