Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc85cE9Q6B2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc85cE9Q6B2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc85cE9Q6B2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc85cE9Q6B2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc85cE9Q6B2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc85cE9Q6B2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc85cE9Q6B2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc85cE9Q6B2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc85cE9Q6B2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc85cE9Q6B2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc85cE9Q6B2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc85cE9Q6B2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc85cE9Q6B2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc85cE9Q6B2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc85cE9Q6B2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc85cE9Q6B2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc85cE9Q6B2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc85cE9Q6B2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc85cE9Q6B2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc85cE9Q6B2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc85cE9Q6B2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc85cE9Q6B2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc85cE9Q6B2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc85cE9Q6B2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc85cE9Q6B2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc85cE9Q6B2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc85cE9Q6B2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc85cE9Q6B2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc85cE9Q6B2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc85cE9Q6B2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc85cE9Q6B2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc85cE9Q6B2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc85cE9Q6B2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc85cE9Q6B2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc85cE9Q6B2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc85cE9Q6B2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc85cE9Q6B2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc85cE9Q6B2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc85cE9Q6B2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc85cE9Q6B2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc85cE9Q6B2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc85cE9Q6B2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc85cE9Q6B2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc85cE9Q6B2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc85cE9Q6B2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc85cE9Q6B2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc85cE9Q6B2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc85cE9Q6B2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc85cE9Q6B2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc85cE9Q6B2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc85cE9Q6B2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc85cE9Q6B2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc85cE9Q6B2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc85cE9Q6B2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc85cE9Q6B2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc85cE9Q6B2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc85cE9Q6B2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc85cE9Q6B2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc85cE9Q6B2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc85cE9Q6B2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc85cE9Q6B2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc85cE9Q6B2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc85cE9Q6B2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc85cE9Q6B2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc85cE9Q6B2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms