Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ythdc1E9Q5K9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms