Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm20518E9Q548 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20518E9Q548 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms