Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ccdc71lE9Q4T4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ccdc71lE9Q4T4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ccdc71lE9Q4T4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ccdc71lE9Q4T4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ccdc71lE9Q4T4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ccdc71lE9Q4T4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ccdc71lE9Q4T4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ccdc71lE9Q4T4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ccdc71lE9Q4T4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ccdc71lE9Q4T4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ccdc71lE9Q4T4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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