Protein–RNA interactions for Protein: E9Q271

Wdr17, WD repeat domain 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr17E9Q271 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Wdr17E9Q271 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Wdr17E9Q271 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Wdr17E9Q271 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Wdr17E9Q271 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Wdr17E9Q271 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Wdr17E9Q271 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Wdr17E9Q271 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Wdr17E9Q271 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Wdr17E9Q271 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Wdr17E9Q271 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Wdr17E9Q271 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Wdr17E9Q271 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Wdr17E9Q271 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Wdr17E9Q271 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Wdr17E9Q271 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Wdr17E9Q271 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Wdr17E9Q271 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Wdr17E9Q271 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Wdr17E9Q271 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Wdr17E9Q271 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Wdr17E9Q271 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Wdr17E9Q271 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Wdr17E9Q271 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Wdr17E9Q271 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Wdr17E9Q271 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Wdr17E9Q271 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Wdr17E9Q271 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Wdr17E9Q271 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Wdr17E9Q271 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Wdr17E9Q271 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Wdr17E9Q271 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Wdr17E9Q271 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Wdr17E9Q271 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Wdr17E9Q271 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Wdr17E9Q271 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Wdr17E9Q271 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Wdr17E9Q271 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Wdr17E9Q271 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Wdr17E9Q271 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Wdr17E9Q271 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Wdr17E9Q271 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Wdr17E9Q271 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Wdr17E9Q271 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Wdr17E9Q271 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Wdr17E9Q271 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Wdr17E9Q271 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Wdr17E9Q271 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Wdr17E9Q271 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Wdr17E9Q271 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Wdr17E9Q271 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Wdr17E9Q271 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Wdr17E9Q271 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Wdr17E9Q271 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Wdr17E9Q271 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Wdr17E9Q271 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Wdr17E9Q271 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Wdr17E9Q271 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Wdr17E9Q271 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Wdr17E9Q271 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Wdr17E9Q271 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Wdr17E9Q271 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Wdr17E9Q271 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Wdr17E9Q271 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Wdr17E9Q271 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Wdr17E9Q271 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Wdr17E9Q271 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Wdr17E9Q271 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Wdr17E9Q271 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Wdr17E9Q271 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Wdr17E9Q271 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Wdr17E9Q271 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Wdr17E9Q271 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Wdr17E9Q271 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Wdr17E9Q271 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Wdr17E9Q271 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Wdr17E9Q271 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Wdr17E9Q271 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Wdr17E9Q271 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Wdr17E9Q271 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Wdr17E9Q271 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Wdr17E9Q271 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Wdr17E9Q271 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Wdr17E9Q271 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Wdr17E9Q271 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Wdr17E9Q271 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Wdr17E9Q271 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Wdr17E9Q271 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Wdr17E9Q271 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Wdr17E9Q271 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Wdr17E9Q271 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Wdr17E9Q271 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Wdr17E9Q271 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Wdr17E9Q271 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Wdr17E9Q271 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Wdr17E9Q271 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Wdr17E9Q271 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Wdr17E9Q271 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Wdr17E9Q271 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Wdr17E9Q271 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms