Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1Z0

Krt90, Keratin 90, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt90E9Q1Z0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Krt90E9Q1Z0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt90E9Q1Z0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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