Protein–RNA interactions for Protein: E9PWZ2

Scgb1b20, ABPA20, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scgb1b20E9PWZ2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scgb1b20E9PWZ2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms