Protein–RNA interactions for Protein: E9PUW8

Ccdc24, Coiled-coil domain-containing 24, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc24E9PUW8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc24E9PUW8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc24E9PUW8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc24E9PUW8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc24E9PUW8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc24E9PUW8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc24E9PUW8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc24E9PUW8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc24E9PUW8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc24E9PUW8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc24E9PUW8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc24E9PUW8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc24E9PUW8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc24E9PUW8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc24E9PUW8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc24E9PUW8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc24E9PUW8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc24E9PUW8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc24E9PUW8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc24E9PUW8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc24E9PUW8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc24E9PUW8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc24E9PUW8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc24E9PUW8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc24E9PUW8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc24E9PUW8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc24E9PUW8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc24E9PUW8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc24E9PUW8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc24E9PUW8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc24E9PUW8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc24E9PUW8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc24E9PUW8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc24E9PUW8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc24E9PUW8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc24E9PUW8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc24E9PUW8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc24E9PUW8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc24E9PUW8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc24E9PUW8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc24E9PUW8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc24E9PUW8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc24E9PUW8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc24E9PUW8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc24E9PUW8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc24E9PUW8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc24E9PUW8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms