Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms