Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc170D3YXL0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Ccdc170D3YXL0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms