Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfx8D3YU81 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rfx8D3YU81 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rfx8D3YU81 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfx8D3YU81 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfx8D3YU81 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfx8D3YU81 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfx8D3YU81 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfx8D3YU81 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfx8D3YU81 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfx8D3YU81 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfx8D3YU81 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfx8D3YU81 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfx8D3YU81 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfx8D3YU81 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfx8D3YU81 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfx8D3YU81 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfx8D3YU81 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfx8D3YU81 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfx8D3YU81 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfx8D3YU81 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfx8D3YU81 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfx8D3YU81 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfx8D3YU81 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfx8D3YU81 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfx8D3YU81 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfx8D3YU81 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfx8D3YU81 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfx8D3YU81 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfx8D3YU81 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfx8D3YU81 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfx8D3YU81 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfx8D3YU81 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfx8D3YU81 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfx8D3YU81 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfx8D3YU81 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfx8D3YU81 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfx8D3YU81 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfx8D3YU81 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfx8D3YU81 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfx8D3YU81 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfx8D3YU81 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rfx8D3YU81 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rfx8D3YU81 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rfx8D3YU81 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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