Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nxpe3B9EKK6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nxpe3B9EKK6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nxpe3B9EKK6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nxpe3B9EKK6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Nxpe3B9EKK6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nxpe3B9EKK6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nxpe3B9EKK6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nxpe3B9EKK6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nxpe3B9EKK6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nxpe3B9EKK6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nxpe3B9EKK6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nxpe3B9EKK6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms