Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syce3B5KM66 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syce3B5KM66 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syce3B5KM66 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syce3B5KM66 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syce3B5KM66 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syce3B5KM66 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syce3B5KM66 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syce3B5KM66 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Syce3B5KM66 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syce3B5KM66 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syce3B5KM66 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syce3B5KM66 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syce3B5KM66 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syce3B5KM66 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syce3B5KM66 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syce3B5KM66 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syce3B5KM66 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syce3B5KM66 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syce3B5KM66 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syce3B5KM66 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syce3B5KM66 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syce3B5KM66 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syce3B5KM66 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syce3B5KM66 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syce3B5KM66 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syce3B5KM66 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syce3B5KM66 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syce3B5KM66 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syce3B5KM66 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syce3B5KM66 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syce3B5KM66 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syce3B5KM66 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syce3B5KM66 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syce3B5KM66 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syce3B5KM66 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syce3B5KM66 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Syce3B5KM66 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syce3B5KM66 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syce3B5KM66 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syce3B5KM66 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syce3B5KM66 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syce3B5KM66 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syce3B5KM66 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syce3B5KM66 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syce3B5KM66 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syce3B5KM66 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syce3B5KM66 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syce3B5KM66 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syce3B5KM66 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syce3B5KM66 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syce3B5KM66 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syce3B5KM66 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syce3B5KM66 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syce3B5KM66 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syce3B5KM66 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syce3B5KM66 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syce3B5KM66 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Syce3B5KM66 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syce3B5KM66 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syce3B5KM66 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syce3B5KM66 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syce3B5KM66 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syce3B5KM66 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syce3B5KM66 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syce3B5KM66 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syce3B5KM66 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syce3B5KM66 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syce3B5KM66 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syce3B5KM66 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syce3B5KM66 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syce3B5KM66 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syce3B5KM66 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syce3B5KM66 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syce3B5KM66 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syce3B5KM66 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syce3B5KM66 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syce3B5KM66 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syce3B5KM66 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syce3B5KM66 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syce3B5KM66 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syce3B5KM66 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syce3B5KM66 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syce3B5KM66 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syce3B5KM66 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syce3B5KM66 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syce3B5KM66 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syce3B5KM66 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syce3B5KM66 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syce3B5KM66 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syce3B5KM66 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syce3B5KM66 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syce3B5KM66 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syce3B5KM66 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syce3B5KM66 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syce3B5KM66 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syce3B5KM66 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syce3B5KM66 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syce3B5KM66 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syce3B5KM66 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms