Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Siah3B2RWG3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Siah3B2RWG3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Siah3B2RWG3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Siah3B2RWG3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Siah3B2RWG3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Siah3B2RWG3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Siah3B2RWG3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Siah3B2RWG3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Siah3B2RWG3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Siah3B2RWG3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Siah3B2RWG3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Siah3B2RWG3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Siah3B2RWG3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Siah3B2RWG3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Siah3B2RWG3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Siah3B2RWG3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Siah3B2RWG3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Siah3B2RWG3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Siah3B2RWG3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Siah3B2RWG3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Siah3B2RWG3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Siah3B2RWG3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Siah3B2RWG3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Siah3B2RWG3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Siah3B2RWG3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Siah3B2RWG3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Siah3B2RWG3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Siah3B2RWG3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Siah3B2RWG3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Siah3B2RWG3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Siah3B2RWG3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Siah3B2RWG3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Siah3B2RWG3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Siah3B2RWG3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Siah3B2RWG3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Siah3B2RWG3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Siah3B2RWG3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Siah3B2RWG3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Siah3B2RWG3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Siah3B2RWG3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Siah3B2RWG3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Siah3B2RWG3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Siah3B2RWG3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Siah3B2RWG3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Siah3B2RWG3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Siah3B2RWG3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Siah3B2RWG3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Siah3B2RWG3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Siah3B2RWG3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Siah3B2RWG3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Siah3B2RWG3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Siah3B2RWG3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Siah3B2RWG3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Siah3B2RWG3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Siah3B2RWG3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Siah3B2RWG3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Siah3B2RWG3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Siah3B2RWG3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Siah3B2RWG3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Siah3B2RWG3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Siah3B2RWG3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Siah3B2RWG3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Siah3B2RWG3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Siah3B2RWG3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Siah3B2RWG3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Siah3B2RWG3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Siah3B2RWG3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Siah3B2RWG3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Siah3B2RWG3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Siah3B2RWG3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Siah3B2RWG3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Siah3B2RWG3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Siah3B2RWG3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Siah3B2RWG3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Siah3B2RWG3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Siah3B2RWG3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Siah3B2RWG3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Siah3B2RWG3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Siah3B2RWG3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Siah3B2RWG3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Siah3B2RWG3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Siah3B2RWG3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Siah3B2RWG3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Siah3B2RWG3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Siah3B2RWG3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Siah3B2RWG3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Siah3B2RWG3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Siah3B2RWG3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Siah3B2RWG3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Siah3B2RWG3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Siah3B2RWG3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Siah3B2RWG3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Siah3B2RWG3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Siah3B2RWG3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Siah3B2RWG3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Siah3B2RWG3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Siah3B2RWG3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Siah3B2RWG3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Siah3B2RWG3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms