Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Otud7bB2RUR8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Otud7bB2RUR8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Otud7bB2RUR8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Otud7bB2RUR8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Otud7bB2RUR8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Otud7bB2RUR8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Otud7bB2RUR8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Otud7bB2RUR8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Otud7bB2RUR8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Otud7bB2RUR8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Otud7bB2RUR8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Otud7bB2RUR8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Otud7bB2RUR8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Otud7bB2RUR8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Otud7bB2RUR8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Otud7bB2RUR8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Otud7bB2RUR8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Otud7bB2RUR8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Otud7bB2RUR8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Otud7bB2RUR8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Otud7bB2RUR8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Otud7bB2RUR8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Otud7bB2RUR8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Otud7bB2RUR8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Otud7bB2RUR8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Otud7bB2RUR8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Otud7bB2RUR8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Otud7bB2RUR8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Otud7bB2RUR8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Otud7bB2RUR8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Otud7bB2RUR8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Otud7bB2RUR8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Otud7bB2RUR8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms