Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm2012B1B0R1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms