Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB3

Gm438, MCG65768, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm438B1ASB3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm438B1ASB3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm438B1ASB3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm438B1ASB3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm438B1ASB3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm438B1ASB3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm438B1ASB3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm438B1ASB3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm438B1ASB3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm438B1ASB3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm438B1ASB3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm438B1ASB3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm438B1ASB3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm438B1ASB3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm438B1ASB3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm438B1ASB3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm438B1ASB3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm438B1ASB3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm438B1ASB3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm438B1ASB3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm438B1ASB3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm438B1ASB3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm438B1ASB3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm438B1ASB3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm438B1ASB3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm438B1ASB3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm438B1ASB3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm438B1ASB3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm438B1ASB3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm438B1ASB3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm438B1ASB3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms