Protein–RNA interactions for Protein: B0QZW4

Supt3, Suppressor of Ty 3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt3B0QZW4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Supt3B0QZW4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Supt3B0QZW4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Supt3B0QZW4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Supt3B0QZW4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Supt3B0QZW4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Supt3B0QZW4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Supt3B0QZW4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Supt3B0QZW4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Supt3B0QZW4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Supt3B0QZW4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Supt3B0QZW4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Supt3B0QZW4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Supt3B0QZW4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Supt3B0QZW4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Supt3B0QZW4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Supt3B0QZW4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Supt3B0QZW4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Supt3B0QZW4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Supt3B0QZW4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Supt3B0QZW4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Supt3B0QZW4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Supt3B0QZW4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Supt3B0QZW4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Supt3B0QZW4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Supt3B0QZW4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Supt3B0QZW4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Supt3B0QZW4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Supt3B0QZW4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Supt3B0QZW4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Supt3B0QZW4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Supt3B0QZW4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Supt3B0QZW4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Supt3B0QZW4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Supt3B0QZW4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Supt3B0QZW4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Supt3B0QZW4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Supt3B0QZW4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Supt3B0QZW4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Supt3B0QZW4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Supt3B0QZW4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Supt3B0QZW4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Supt3B0QZW4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Supt3B0QZW4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Supt3B0QZW4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Supt3B0QZW4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Supt3B0QZW4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms