Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms