Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rtf1A2AQ19 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rtf1A2AQ19 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rtf1A2AQ19 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rtf1A2AQ19 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rtf1A2AQ19 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rtf1A2AQ19 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rtf1A2AQ19 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rtf1A2AQ19 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rtf1A2AQ19 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rtf1A2AQ19 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Rtf1A2AQ19 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Rtf1A2AQ19 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rtf1A2AQ19 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rtf1A2AQ19 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rtf1A2AQ19 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rtf1A2AQ19 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rtf1A2AQ19 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rtf1A2AQ19 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rtf1A2AQ19 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rtf1A2AQ19 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rtf1A2AQ19 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rtf1A2AQ19 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rtf1A2AQ19 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rtf1A2AQ19 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rtf1A2AQ19 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rtf1A2AQ19 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rtf1A2AQ19 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rtf1A2AQ19 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rtf1A2AQ19 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rtf1A2AQ19 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Rtf1A2AQ19 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rtf1A2AQ19 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rtf1A2AQ19 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rtf1A2AQ19 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rtf1A2AQ19 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rtf1A2AQ19 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Rtf1A2AQ19 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rtf1A2AQ19 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rtf1A2AQ19 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rtf1A2AQ19 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rtf1A2AQ19 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rtf1A2AQ19 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rtf1A2AQ19 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rtf1A2AQ19 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rtf1A2AQ19 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rtf1A2AQ19 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rtf1A2AQ19 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rtf1A2AQ19 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rtf1A2AQ19 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rtf1A2AQ19 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rtf1A2AQ19 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rtf1A2AQ19 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rtf1A2AQ19 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rtf1A2AQ19 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rtf1A2AQ19 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rtf1A2AQ19 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rtf1A2AQ19 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rtf1A2AQ19 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rtf1A2AQ19 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rtf1A2AQ19 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rtf1A2AQ19 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Rtf1A2AQ19 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rtf1A2AQ19 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rtf1A2AQ19 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rtf1A2AQ19 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rtf1A2AQ19 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rtf1A2AQ19 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rtf1A2AQ19 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rtf1A2AQ19 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rtf1A2AQ19 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rtf1A2AQ19 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rtf1A2AQ19 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rtf1A2AQ19 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rtf1A2AQ19 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rtf1A2AQ19 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Rtf1A2AQ19 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rtf1A2AQ19 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rtf1A2AQ19 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rtf1A2AQ19 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rtf1A2AQ19 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rtf1A2AQ19 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rtf1A2AQ19 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rtf1A2AQ19 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Rtf1A2AQ19 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rtf1A2AQ19 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rtf1A2AQ19 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rtf1A2AQ19 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rtf1A2AQ19 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rtf1A2AQ19 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rtf1A2AQ19 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Rtf1A2AQ19 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rtf1A2AQ19 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rtf1A2AQ19 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rtf1A2AQ19 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rtf1A2AQ19 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rtf1A2AQ19 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rtf1A2AQ19 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rtf1A2AQ19 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rtf1A2AQ19 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
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