Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Frmpd1A2AKB4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Frmpd1A2AKB4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Frmpd1A2AKB4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Frmpd1A2AKB4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Frmpd1A2AKB4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Frmpd1A2AKB4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Frmpd1A2AKB4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
Frmpd1A2AKB4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Frmpd1A2AKB4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Frmpd1A2AKB4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Frmpd1A2AKB4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Frmpd1A2AKB4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Frmpd1A2AKB4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Frmpd1A2AKB4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Frmpd1A2AKB4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Frmpd1A2AKB4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
Frmpd1A2AKB4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Frmpd1A2AKB4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Frmpd1A2AKB4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Frmpd1A2AKB4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
Frmpd1A2AKB4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Frmpd1A2AKB4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Frmpd1A2AKB4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Frmpd1A2AKB4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Frmpd1A2AKB4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Frmpd1A2AKB4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Frmpd1A2AKB4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Frmpd1A2AKB4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Frmpd1A2AKB4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Frmpd1A2AKB4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Frmpd1A2AKB4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Frmpd1A2AKB4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Frmpd1A2AKB4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Frmpd1A2AKB4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Frmpd1A2AKB4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Frmpd1A2AKB4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Frmpd1A2AKB4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Frmpd1A2AKB4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Frmpd1A2AKB4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Frmpd1A2AKB4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Frmpd1A2AKB4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Frmpd1A2AKB4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Frmpd1A2AKB4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Frmpd1A2AKB4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Frmpd1A2AKB4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Frmpd1A2AKB4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Frmpd1A2AKB4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Frmpd1A2AKB4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Frmpd1A2AKB4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Frmpd1A2AKB4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Frmpd1A2AKB4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Frmpd1A2AKB4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Frmpd1A2AKB4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Frmpd1A2AKB4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Frmpd1A2AKB4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Frmpd1A2AKB4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Frmpd1A2AKB4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Frmpd1A2AKB4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Frmpd1A2AKB4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Frmpd1A2AKB4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Frmpd1A2AKB4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Frmpd1A2AKB4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Frmpd1A2AKB4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Frmpd1A2AKB4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Frmpd1A2AKB4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
Frmpd1A2AKB4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Frmpd1A2AKB4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Frmpd1A2AKB4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Frmpd1A2AKB4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Frmpd1A2AKB4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Frmpd1A2AKB4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Frmpd1A2AKB4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Frmpd1A2AKB4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Frmpd1A2AKB4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Frmpd1A2AKB4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Frmpd1A2AKB4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Frmpd1A2AKB4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Frmpd1A2AKB4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Frmpd1A2AKB4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Frmpd1A2AKB4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Frmpd1A2AKB4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
Frmpd1A2AKB4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Frmpd1A2AKB4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Frmpd1A2AKB4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Frmpd1A2AKB4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Frmpd1A2AKB4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Frmpd1A2AKB4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Frmpd1A2AKB4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Frmpd1A2AKB4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Frmpd1A2AKB4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Frmpd1A2AKB4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Frmpd1A2AKB4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Frmpd1A2AKB4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Frmpd1A2AKB4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Frmpd1A2AKB4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Frmpd1A2AKB4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Frmpd1A2AKB4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Frmpd1A2AKB4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Frmpd1A2AKB4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms