Protein–RNA interactions for Protein: A2AGX3

Prdm11, PR domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm11A2AGX3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Prdm11A2AGX3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prdm11A2AGX3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prdm11A2AGX3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prdm11A2AGX3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prdm11A2AGX3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prdm11A2AGX3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prdm11A2AGX3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prdm11A2AGX3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prdm11A2AGX3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prdm11A2AGX3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prdm11A2AGX3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prdm11A2AGX3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prdm11A2AGX3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prdm11A2AGX3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prdm11A2AGX3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prdm11A2AGX3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prdm11A2AGX3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prdm11A2AGX3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prdm11A2AGX3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prdm11A2AGX3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prdm11A2AGX3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prdm11A2AGX3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prdm11A2AGX3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prdm11A2AGX3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prdm11A2AGX3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prdm11A2AGX3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Prdm11A2AGX3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Prdm11A2AGX3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prdm11A2AGX3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Prdm11A2AGX3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prdm11A2AGX3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prdm11A2AGX3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prdm11A2AGX3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Prdm11A2AGX3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prdm11A2AGX3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prdm11A2AGX3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prdm11A2AGX3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prdm11A2AGX3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prdm11A2AGX3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prdm11A2AGX3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prdm11A2AGX3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prdm11A2AGX3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prdm11A2AGX3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prdm11A2AGX3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prdm11A2AGX3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prdm11A2AGX3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prdm11A2AGX3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prdm11A2AGX3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prdm11A2AGX3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prdm11A2AGX3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prdm11A2AGX3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prdm11A2AGX3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prdm11A2AGX3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prdm11A2AGX3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prdm11A2AGX3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Prdm11A2AGX3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prdm11A2AGX3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Prdm11A2AGX3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Prdm11A2AGX3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prdm11A2AGX3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prdm11A2AGX3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prdm11A2AGX3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prdm11A2AGX3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prdm11A2AGX3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prdm11A2AGX3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prdm11A2AGX3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prdm11A2AGX3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prdm11A2AGX3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prdm11A2AGX3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prdm11A2AGX3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Prdm11A2AGX3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prdm11A2AGX3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prdm11A2AGX3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prdm11A2AGX3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm11A2AGX3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm11A2AGX3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm11A2AGX3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm11A2AGX3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm11A2AGX3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm11A2AGX3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm11A2AGX3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm11A2AGX3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm11A2AGX3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm11A2AGX3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm11A2AGX3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prdm11A2AGX3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prdm11A2AGX3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prdm11A2AGX3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prdm11A2AGX3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prdm11A2AGX3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prdm11A2AGX3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prdm11A2AGX3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prdm11A2AGX3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prdm11A2AGX3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prdm11A2AGX3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prdm11A2AGX3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prdm11A2AGX3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prdm11A2AGX3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prdm11A2AGX3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms