Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Frmpd4A2AFR3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Frmpd4A2AFR3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Frmpd4A2AFR3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Frmpd4A2AFR3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Frmpd4A2AFR3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Frmpd4A2AFR3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Frmpd4A2AFR3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Frmpd4A2AFR3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Frmpd4A2AFR3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Frmpd4A2AFR3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Frmpd4A2AFR3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Frmpd4A2AFR3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Frmpd4A2AFR3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Frmpd4A2AFR3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Frmpd4A2AFR3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Frmpd4A2AFR3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Frmpd4A2AFR3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Frmpd4A2AFR3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Frmpd4A2AFR3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Frmpd4A2AFR3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Frmpd4A2AFR3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Frmpd4A2AFR3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Frmpd4A2AFR3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Frmpd4A2AFR3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Frmpd4A2AFR3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Frmpd4A2AFR3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Frmpd4A2AFR3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Frmpd4A2AFR3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Frmpd4A2AFR3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Frmpd4A2AFR3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Frmpd4A2AFR3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Frmpd4A2AFR3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Frmpd4A2AFR3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Frmpd4A2AFR3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Frmpd4A2AFR3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Frmpd4A2AFR3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Frmpd4A2AFR3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Frmpd4A2AFR3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Frmpd4A2AFR3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Frmpd4A2AFR3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Frmpd4A2AFR3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Frmpd4A2AFR3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Frmpd4A2AFR3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Frmpd4A2AFR3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Frmpd4A2AFR3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Frmpd4A2AFR3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Frmpd4A2AFR3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Frmpd4A2AFR3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Frmpd4A2AFR3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Frmpd4A2AFR3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Frmpd4A2AFR3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Frmpd4A2AFR3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Frmpd4A2AFR3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Frmpd4A2AFR3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Frmpd4A2AFR3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Frmpd4A2AFR3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frmpd4A2AFR3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms