Protein–RNA interactions for Protein: A2AE42

Cyb561d1, Cytochrome b561 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561d1A2AE42 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyb561d1A2AE42 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms